La historia se centra en torno a un chico llamado Akihisa Yoshii , también conocido como el tonto ("baka" en japonés) del título. Él asiste a la Academia Fumizuki , una escuela donde el personal divide rígidamente a los estudiantes sobre la base de los resultados de sus exámenes. En este caso, la clase A está compuesta de estudiantes con las más altas calificaciones, por lo que su clase está llena de lujos (aparatos de aire acondicionado, asientos de lujo, amplios espacios, etc.), mientras que el resto de clases reducen su calidad mientras más se alejan del inicio del abecedario; es así como la clase F por ser la última recibe a los alumnos con los peores resultados. Esta academia tiene algo especial, donde todos los estudiantes pueden manifestar seres " Convocados " (Shōkanjū). Estos seres, cuyos puntos de fuerza son medidos por las calificaciones —que sus convocadores obtuvieron en sus exámenes— se utilizan para las batallas entre las clases (ESB a partir